高電場強(qiáng)度電泳時,除了降低核酸樣品的熱效應(yīng),還需要注意以下問題:
防止凝膠破裂:高電場強(qiáng)度下,凝膠內(nèi)部會產(chǎn)生較大的應(yīng)力,容易導(dǎo)致凝膠破裂。因此,要確保凝膠的制備質(zhì)量,凝膠濃度均勻、凝固充分;同時,在電泳過程中要避免電泳槽受到震動或碰撞。
避免電極腐蝕:高電場強(qiáng)度可能會加速電極的腐蝕,尤其是在長時間電泳或使用高離子強(qiáng)度緩沖液時。應(yīng)選擇質(zhì)量好、耐腐蝕的電極,如鉑電極;定期檢查電極的狀況,如有腐蝕及時更換;并且在電泳結(jié)束后,及時清洗電極,去除表面的電解質(zhì)和雜質(zhì)。
注意安全:高電場強(qiáng)度電泳使用的電壓較高,存在觸電風(fēng)險(xiǎn)。操作時要確保電泳設(shè)備接地良好,使用絕緣手套和護(hù)目鏡等防護(hù)裝備;在電泳過程中,不要觸摸電泳槽和電極,避免發(fā)生觸電事故。
考慮核酸分子的構(gòu)象變化:高電場強(qiáng)度可能會使核酸分子的構(gòu)象發(fā)生變化,從而影響其遷移行為。對于一些特殊結(jié)構(gòu)的核酸分子,如超螺旋 DNA 或具有復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)的 RNA,可能需要在緩沖液中加入適量的輔助試劑,如尿素、甲酰胺等,以幫助維持核酸分子的天然構(gòu)象,保證電泳結(jié)果的準(zhǔn)確性。
防止樣品擴(kuò)散:高電場強(qiáng)度下,樣品在凝膠中的擴(kuò)散速度可能會加快,導(dǎo)致條帶變寬,分辨率下降??赏ㄟ^在樣品中加入適量的蔗糖或甘油等密度試劑,增加樣品的密度,減少擴(kuò)散;同時,盡量縮短電泳時間,也有助于降低樣品的擴(kuò)散程度。
準(zhǔn)確選擇 Marker:由于高電場強(qiáng)度下核酸分子的遷移速度可能與常規(guī)條件不同,需要選擇合適的分子量 Marker 作為參照。最好選擇在高電場強(qiáng)度下遷移行為穩(wěn)定、條帶清晰的 Marker,以便準(zhǔn)確判斷核酸分子的大小和遷移情況。
確保設(shè)備穩(wěn)定:電泳設(shè)備的穩(wěn)定性對高電場強(qiáng)度電泳至關(guān)重要。使用前要檢查設(shè)備的電源、電極連接等是否正常,避免在電泳過程中出現(xiàn)電壓波動或設(shè)備故障,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。